L'Ordine è un Ente pubblico non economico a carattere associativo, è dotato di autonomia patrimoniale e finanziaria, determina la propria organizzazione con appositi regolamenti, nel rispetto delle disposizioni di legge e del D. Lgs. 139/2005 ed è soggetto esclusivamente alla vigilanza del CNDCEC e del Ministero della Giustizia. L’Ordine svolge le sue funzioni e persegue le sue finalitá istituzionali attraverso il Consiglio. Il Consiglio, composto da 15 membri, nominato dall'Assemblea degli Iscritti e dura in carica quattro anni. Il mandato è rinnovabile per non più di due volte consecutive.
Il Consiglio nomina, al suo interno, il Vicepresidente, il Segretario e il Tesoriere; il Presidente è nominato dall’Assemblea degli Iscritti.
Il Consiglio in carica stato eletto dall'Assemblea degli Iscritti all'Albo dell'Ordine dei Dottori Commercialisti e degli Esperti Contabili di Napoli, il 15 e 16 novembre 2012, si è insediato il 1° di gennaio 2013 e resterá in carica fino al 31 dicembre 2016.